不同地區的合作醫療報銷比例有所差異，此處以長沙為例：

一：門診。

（1）村衛生室：醫院支付比例70%，參保居民支付30%；

（2）鄉鎮衛生院、社區衛生服務中心：醫院支付比例60%，參保居民支付40%；

（3）院校醫院或醫務室：醫院支付比例70%，參保大中專學生、以學校為單位整體參保的普通學生自負30%；

（4）一個結算年度內發生的政策范圍內門診醫療費用最高支付限額為800。

二：住院。

（1）鄉鎮衛生院、社區衛生服務機構：起付標準200，可報銷85%；

（2）三類收費標準醫療機構、縣級二類收費標準醫療機構：起付標準300，可報銷70%；

（3）其他二類收費標準醫療機構：起付標準500，可報銷60%；

（4）市級一類收費標準醫療機構：起付標準1100，可報銷60%；

（5）一個結算年度內，累計最高支付限額為15萬。

三：生育。

（1）平產，最高可補助1300；

（2）剖宮產，最高可補助1600；

（3）孕產婦因為高危重癥救治而發生的政策范圍內住院醫療費用，可參照疾病住院的相關標準進行報銷支付；

四：大病醫療。

（1）普通群眾：起付標準為22324，0至3萬（含）部分可報銷60%、3萬至8萬（含）部分可報銷65%、8萬至15萬（含）部分可報銷75%、15萬以上可報銷85%，年度限額統一為40萬；

（2）困難群眾，包括特困人員、低保對象、返貧致貧人口，起付線為11165，0至3萬（含）部分可報銷65%、3萬至8萬（含）部分可報銷70%、8萬至15萬（含）部分可報銷80%、15萬以上可報銷90%，無封頂。