保險公司是否理賠自然災害造成的車輛損失取決于車主是否購買了車輛損失保險。

車損險屬于商業車險，車主可根據自身實際保障需要和保費預算選擇投保，其主要保障范圍包括：如發生保險事故，如碰撞、傾覆、墜落、火災、爆炸、自燃、外部物體墜落/倒塌、風暴、雷擊、冰雹、暴雨、地陷、冰、懸崖崩塌、雪崩、泥石流、滑坡、滑坡、地震、洪水、海嘯、龍卷風、運輸保險車輛渡船遭受自然災害（僅限于司機），保險機動車損壞，保險公司可以根據保險合同，在保險金額內。

此外，在保險事故發生后，保險公司還可以承擔車輛損壞保險金額內的索賠責任，以防止或減少被保險機動車的損失。

因此，如果車主購買了汽車損壞保險，并發生了汽車損壞保險合同約定的自然災害，保險公司可以承擔索賠責任。但是，如果車主未購買汽車損壞保險，或者自然災害不屬于保險合同約定的范圍，保險公司不承擔索賠責任。